MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 42519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012924	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750924
2	NC_012924	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	253750924
3	NC_012924	A	6	6	148	153	100 %	0 %	0 %	0 %	253750924
4	NC_012924	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	253750924
5	NC_012924	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750924
6	NC_012924	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750924
7	NC_012924	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253750924
8	NC_012924	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750924
9	NC_012924	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750924
10	NC_012924	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750924
11	NC_012924	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750924
12	NC_012924	A	7	7	631	637	100 %	0 %	0 %	0 %	253750924
13	NC_012924	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	253750924
14	NC_012924	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750924
15	NC_012924	TC	3	6	679	684	0 %	50 %	0 %	50 %	253750924
16	NC_012924	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750924
17	NC_012924	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750924
18	NC_012924	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750924
19	NC_012924	A	7	7	740	746	100 %	0 %	0 %	0 %	253750924
20	NC_012924	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750924
21	NC_012924	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	253750924
22	NC_012924	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	253750924
23	NC_012924	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750924
24	NC_012924	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	253750924
25	NC_012924	CG	3	6	1188	1193	0 %	0 %	50 %	50 %	253750924
26	NC_012924	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	253750924
27	NC_012924	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	253750924
28	NC_012924	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	253750924
29	NC_012924	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253750924
30	NC_012924	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750924
31	NC_012924	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	253750924
32	NC_012924	T	6	6	1387	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012924	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012924	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012924	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012924	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012924	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012924	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750925
39	NC_012924	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	253750925
40	NC_012924	A	6	6	1599	1604	100 %	0 %	0 %	0 %	253750925
41	NC_012924	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750925
42	NC_012924	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750925
43	NC_012924	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	253750925
44	NC_012924	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750925
45	NC_012924	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750925
46	NC_012924	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750925
47	NC_012924	TC	3	6	2146	2151	0 %	50 %	0 %	50 %	253750925
48	NC_012924	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750925
49	NC_012924	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750925
50	NC_012924	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750925
51	NC_012924	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750925
52	NC_012924	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	253750925
53	NC_012924	ACCG	2	8	2281	2288	25 %	0 %	25 %	50 %	253750925
54	NC_012924	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750925
55	NC_012924	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750925
56	NC_012924	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750925
57	NC_012924	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750925
58	NC_012924	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	253750925
59	NC_012924	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750925
60	NC_012924	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	253750925
61	NC_012924	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750925
62	NC_012924	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012924	A	6	6	2708	2713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012924	TA	3	6	2732	2737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012924	TA	4	8	2763	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	253750926
66	NC_012924	CTG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750926
67	NC_012924	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	253750926
68	NC_012924	AAAG	2	8	2825	2832	75 %	0 %	25 %	0 %	253750926
69	NC_012924	A	6	6	2883	2888	100 %	0 %	0 %	0 %	253750926
70	NC_012924	AGT	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750926
71	NC_012924	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750926
72	NC_012924	TA	3	6	3063	3068	50 %	50 %	0 %	0 %	253750926
73	NC_012924	AG	3	6	3088	3093	50 %	0 %	50 %	0 %	253750926
74	NC_012924	AT	3	6	3107	3112	50 %	50 %	0 %	0 %	253750926
75	NC_012924	A	7	7	3203	3209	100 %	0 %	0 %	0 %	253750926
76	NC_012924	ATT	2	6	3265	3270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750926
77	NC_012924	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750926
78	NC_012924	T	6	6	3335	3340	0 %	100 %	0 %	0 %	253750926
79	NC_012924	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750926
80	NC_012924	GAAG	2	8	3409	3416	50 %	0 %	50 %	0 %	253750926
81	NC_012924	TTA	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750926
82	NC_012924	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750926
83	NC_012924	ATT	3	9	3556	3564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750926
84	NC_012924	GA	3	6	3576	3581	50 %	0 %	50 %	0 %	253750926
85	NC_012924	GTAT	2	8	3624	3631	25 %	50 %	25 %	0 %	253750926
86	NC_012924	AGG	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253750926
87	NC_012924	TCA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750927
88	NC_012924	TAA	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750927
89	NC_012924	ATG	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750927
90	NC_012924	ACT	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012924	A	6	6	3933	3938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012924	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012924	TGG	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750928
94	NC_012924	AAC	2	6	4177	4182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750928
95	NC_012924	AATG	2	8	4190	4197	50 %	25 %	25 %	0 %	253750928
96	NC_012924	GAA	2	6	4215	4220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750928
97	NC_012924	TGT	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750928
98	NC_012924	ATT	2	6	4289	4294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750928
99	NC_012924	ATT	2	6	4303	4308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750928
100	NC_012924	A	8	8	4390	4397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012924	CAG	2	6	4409	4414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750929
102	NC_012924	TCG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750929
103	NC_012924	TCA	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750929
104	NC_012924	AAAT	2	8	4659	4666	75 %	25 %	0 %	0 %	253750929
105	NC_012924	AG	3	6	4821	4826	50 %	0 %	50 %	0 %	253750929
106	NC_012924	CAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750929
107	NC_012924	A	6	6	4853	4858	100 %	0 %	0 %	0 %	253750929
108	NC_012924	A	6	6	4910	4915	100 %	0 %	0 %	0 %	253750929
109	NC_012924	AGA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750929
110	NC_012924	GAA	2	6	4969	4974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750929
111	NC_012924	A	6	6	4976	4981	100 %	0 %	0 %	0 %	253750929
112	NC_012924	TGA	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750929
113	NC_012924	GCA	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750929
114	NC_012924	GTG	3	9	5119	5127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750929
115	NC_012924	GAA	3	9	5143	5151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750929
116	NC_012924	CGA	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750929
117	NC_012924	CTTG	2	8	5247	5254	0 %	50 %	25 %	25 %	253750929
118	NC_012924	CAG	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750929
119	NC_012924	AGG	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253750929
120	NC_012924	CTC	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253750929
121	NC_012924	GAT	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750929
122	NC_012924	AAG	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750929
123	NC_012924	GAA	2	6	5452	5457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750929
124	NC_012924	CAT	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750929
125	NC_012924	TTC	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012924	GTT	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012924	GAT	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012924	TTGG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012924	A	6	6	5667	5672	100 %	0 %	0 %	0 %	253750930
130	NC_012924	GATT	2	8	5679	5686	25 %	50 %	25 %	0 %	253750930
131	NC_012924	AAACA	2	10	5721	5730	80 %	0 %	0 %	20 %	253750930
132	NC_012924	TGC	2	6	5745	5750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750930
133	NC_012924	A	6	6	5838	5843	100 %	0 %	0 %	0 %	253750930
134	NC_012924	ATGA	2	8	5870	5877	50 %	25 %	25 %	0 %	253750930
135	NC_012924	TTA	2	6	5908	5913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750930
136	NC_012924	TAG	2	6	5937	5942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750930
137	NC_012924	GAC	2	6	5948	5953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750930
138	NC_012924	TGG	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750930
139	NC_012924	TGTCT	2	10	6112	6121	0 %	60 %	20 %	20 %	253750930
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141	NC_012924	GAT	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750930
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143	NC_012924	AATC	2	8	6301	6308	50 %	25 %	0 %	25 %	253750931
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153	NC_012924	GAGAT	2	10	6830	6839	40 %	20 %	40 %	0 %	253750931
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200	NC_012924	GTA	2	6	9430	9435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750931
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267	NC_012924	AGA	2	6	12085	12090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750936
268	NC_012924	GCG	2	6	12092	12097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253750936
269	NC_012924	T	6	6	12116	12121	0 %	100 %	0 %	0 %	253750936
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271	NC_012924	CCA	2	6	12166	12171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253750936
272	NC_012924	GAT	2	6	12176	12181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750936
273	NC_012924	GATT	2	8	12204	12211	25 %	50 %	25 %	0 %	253750936
274	NC_012924	GGCG	2	8	12215	12222	0 %	0 %	75 %	25 %	253750936
275	NC_012924	GCA	2	6	12339	12344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750936
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382	NC_012924	A	6	6	16595	16600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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386	NC_012924	A	7	7	16763	16769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
387	NC_012924	A	6	6	16775	16780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
388	NC_012924	AGA	2	6	16862	16867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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392	NC_012924	CGC	2	6	17373	17378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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394	NC_012924	TGT	2	6	17412	17417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
395	NC_012924	AGA	2	6	17421	17426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
396	NC_012924	AGA	2	6	17433	17438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
397	NC_012924	CAG	2	6	17495	17500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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399	NC_012924	AT	3	6	17679	17684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_012924	GGA	2	6	17685	17690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
401	NC_012924	CT	3	6	17710	17715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
402	NC_012924	GAA	2	6	17949	17954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
403	NC_012924	GGT	2	6	18023	18028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
404	NC_012924	GTC	2	6	18037	18042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_012924	TCGTG	2	10	18046	18055	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
406	NC_012924	CAT	2	6	18105	18110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
407	NC_012924	TAA	2	6	18140	18145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
408	NC_012924	GGA	2	6	18149	18154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
409	NC_012924	ATC	2	6	18173	18178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
410	NC_012924	AC	3	6	18200	18205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
411	NC_012924	CGC	2	6	18339	18344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
412	NC_012924	AC	3	6	18369	18374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
413	NC_012924	CAC	2	6	18384	18389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
414	NC_012924	AGCC	2	8	18432	18439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
415	NC_012924	GAT	2	6	18455	18460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
416	NC_012924	CCT	2	6	18511	18516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
417	NC_012924	TCT	2	6	18546	18551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
418	NC_012924	AGG	2	6	18612	18617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
419	NC_012924	AAC	2	6	18647	18652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_012924	GTT	2	6	18657	18662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
421	NC_012924	A	6	6	18792	18797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_012924	ATC	2	6	18850	18855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_012924	AGT	2	6	18858	18863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
424	NC_012924	GTTAA	2	10	18925	18934	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
425	NC_012924	ACG	2	6	18988	18993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_012924	GTAA	2	8	19011	19018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
427	NC_012924	TCAC	2	8	19068	19075	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
428	NC_012924	TAG	2	6	19159	19164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
429	NC_012924	GCGA	2	8	19167	19174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
430	NC_012924	AGG	2	6	19181	19186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
431	NC_012924	GAG	2	6	19194	19199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
432	NC_012924	CTC	2	6	19204	19209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
433	NC_012924	AGA	2	6	19246	19251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
434	NC_012924	AG	3	6	19274	19279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
435	NC_012924	T	6	6	19302	19307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_012924	TCG	2	6	19349	19354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_012924	GGA	2	6	19362	19367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
438	NC_012924	CT	3	6	19388	19393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
439	NC_012924	ACA	2	6	19480	19485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_012924	ATG	2	6	19547	19552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
441	NC_012924	TAT	2	6	19612	19617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_012924	GGA	2	6	19680	19685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
443	NC_012924	TC	3	6	19766	19771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
444	NC_012924	ACC	2	6	19946	19951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
445	NC_012924	AAT	2	6	19966	19971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_012924	ATTC	2	8	20033	20040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
448	NC_012924	TG	3	6	20157	20162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
449	NC_012924	AAG	2	6	20163	20168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
450	NC_012924	GAG	2	6	20178	20183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
451	NC_012924	GA	3	6	20308	20313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
452	NC_012924	ACA	2	6	20334	20339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_012924	CTAA	2	8	20389	20396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
454	NC_012924	GA	3	6	20604	20609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
455	NC_012924	CT	3	6	20720	20725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
456	NC_012924	GAT	2	6	20738	20743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_012924	CAG	2	6	21960	21965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
470	NC_012924	AGT	2	6	21986	21991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_012924	TCC	2	6	23126	23131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
481	NC_012924	CTA	2	6	23136	23141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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488	NC_012924	AT	3	6	23562	23567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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